Asunto(s)
Betacoronavirus , Control de Enfermedades Transmisibles , Infecciones por Coronavirus , Transmisión de Enfermedad Infecciosa , Salud Global/estadística & datos numéricos , Pandemias , Neumonía Viral , Betacoronavirus/aislamiento & purificación , Betacoronavirus/patogenicidad , COVID-19 , Control de Enfermedades Transmisibles/métodos , Control de Enfermedades Transmisibles/organización & administración , Control de Enfermedades Transmisibles/normas , Infecciones por Coronavirus/epidemiología , Infecciones por Coronavirus/prevención & control , Infecciones por Coronavirus/transmisión , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/estadística & datos numéricos , Humanos , Internacionalidad , Mortalidad , Pandemias/prevención & control , Neumonía Viral/epidemiología , Neumonía Viral/prevención & control , Neumonía Viral/transmisión , Mejoramiento de la Calidad , SARS-CoV-2Asunto(s)
Número Básico de Reproducción/estadística & datos numéricos , Infecciones por Coronavirus , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/estadística & datos numéricos , Monitoreo Epidemiológico , Pandemias , Neumonía Viral , Betacoronavirus/aislamiento & purificación , Sesgo , COVID-19 , Infecciones por Coronavirus/epidemiología , Infecciones por Coronavirus/prevención & control , Infecciones por Coronavirus/transmisión , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Mediciones Epidemiológicas , Salud Global , Humanos , Pandemias/prevención & control , Pandemias/estadística & datos numéricos , Neumonía Viral/epidemiología , Neumonía Viral/prevención & control , Neumonía Viral/transmisión , SARS-CoV-2 , Suiza/epidemiologíaRESUMEN
Following the rapid dissemination of COVID-19 cases in Switzerland, large-scale non-pharmaceutical interventions (NPIs) were implemented by the cantons and the federal government between 28 February and 20 March 2020. Estimates of the impact of these interventions on SARS-CoV-2 transmission are critical for decision making in this and future outbreaks. We here aim to assess the impact of these NPIs on disease transmission by estimating changes in the basic reproduction number (R0) at national and cantonal levels in relation to the timing of these NPIs. We estimated the time-varying R0 nationally and in eleven cantons by fitting a stochastic transmission model explicitly simulating within-hospital dynamics. We used individual-level data from more than 1000 hospitalised patients in Switzerland and public daily reports of hospitalisations and deaths. We estimated the national R0 to be 2.8 (95% confidence interval 2.1–3.8) at the beginning of the epidemic. Starting from around 7 March, we found a strong reduction in time-varying R0 with a 86% median decrease (95% quantile range [QR] 79–90%) to a value of 0.40 (95% QR 0.3–0.58) in the period of 29 March to 5 April. At the cantonal level, R0 decreased over the course of the epidemic between 53% and 92%. Reductions in time-varying R0 were synchronous with changes in mobility patterns as estimated through smartphone activity, which started before the official implementation of NPIs. We inferred that most of the reduction of transmission is attributable to behavioural changes as opposed to natural immunity, the latter accounting for only about 4% of the total reduction in effective transmission. As Switzerland considers relaxing some of the restrictions of social mixing, current estimates of time-varying R0 well below one are promising. However, as of 24 April 2020, at least 96% (95% QR 95.7–96.4%) of the Swiss population remains susceptible to SARS-CoV-2. These results warrant a cautious relaxation of social distance practices and close monitoring of changes in both the basic and effective reproduction numbers.
Asunto(s)
Betacoronavirus/aislamiento & purificación , Control de Enfermedades Transmisibles , Infecciones por Coronavirus , Transmisión de Enfermedad Infecciosa , Pandemias/estadística & datos numéricos , Neumonía Viral , COVID-19 , Control de Enfermedades Transmisibles/métodos , Control de Enfermedades Transmisibles/organización & administración , Control de Enfermedades Transmisibles/estadística & datos numéricos , Enfermedades Transmisibles Emergentes/prevención & control , Infecciones por Coronavirus/epidemiología , Infecciones por Coronavirus/prevención & control , Infecciones por Coronavirus/transmisión , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/estadística & datos numéricos , Hospitalización/estadística & datos numéricos , Humanos , Modelos Estadísticos , Mortalidad , Pandemias/prevención & control , Neumonía Viral/epidemiología , Neumonía Viral/prevención & control , Neumonía Viral/transmisión , SARS-CoV-2 , Agrupamiento Espacio-Temporal , Procesos EstocásticosAsunto(s)
Betacoronavirus , Infecciones por Coronavirus/epidemiología , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Pandemias , Neumonía Viral/epidemiología , Cuarentena/métodos , Universidades , COVID-19 , Infecciones por Coronavirus/transmisión , Salud Global , Humanos , Neumonía Viral/transmisión , SARS-CoV-2Asunto(s)
Betacoronavirus , Infecciones por Coronavirus/epidemiología , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Guías como Asunto , Máscaras/estadística & datos numéricos , Pandemias/prevención & control , Neumonía Viral/epidemiología , COVID-19 , Infecciones por Coronavirus/transmisión , Humanos , Neumonía Viral/transmisión , SARS-CoV-2 , Estados Unidos/epidemiologíaAsunto(s)
Prueba de COVID-19/métodos , COVID-19/transmisión , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/estadística & datos numéricos , Grupo de Atención al Paciente , COVID-19/epidemiología , COVID-19/prevención & control , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Humanos , Comunicación Interdisciplinaria , Estados Unidos/epidemiologíaAsunto(s)
COVID-19 , Personal de Salud , Control de Infecciones , Estrés Laboral , Gestión de Riesgos/métodos , Bangladesh/epidemiología , COVID-19/epidemiología , COVID-19/prevención & control , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Necesidades y Demandas de Servicios de Salud/tendencias , Humanos , Control de Infecciones/métodos , Control de Infecciones/organización & administración , Salud Laboral/normas , Salud Laboral/tendencias , Estrés Laboral/epidemiología , Estrés Laboral/prevención & control , SARS-CoV-2Asunto(s)
Infecciones Asintomáticas , COVID-19 , Control de Enfermedades Transmisibles , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , SARS-CoV-2/aislamiento & purificación , Infecciones Asintomáticas/epidemiología , Infecciones Asintomáticas/terapia , COVID-19/diagnóstico , COVID-19/epidemiología , COVID-19/prevención & control , COVID-19/virología , Control de Enfermedades Transmisibles/métodos , Control de Enfermedades Transmisibles/organización & administración , Humanos , Evaluación de Necesidades , Salud Laboral/normas , Salud Pública/normas , SARS-CoV-2/fisiologíaAsunto(s)
Prueba de COVID-19/métodos , COVID-19 , Trazado de Contacto/métodos , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Composición Familiar , SARS-CoV-2/aislamiento & purificación , Infecciones Asintomáticas/epidemiología , COVID-19/diagnóstico , COVID-19/epidemiología , COVID-19/prevención & control , Control de Enfermedades Transmisibles/métodos , Países en Desarrollo , Vivienda , Humanos , Pakistán/epidemiología , Salud Pública/métodosAsunto(s)
Prueba de COVID-19/métodos , COVID-19 , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Control de Infecciones , Reinserción al Trabajo , SARS-CoV-2/aislamiento & purificación , Lugar de Trabajo , Adulto , COVID-19/diagnóstico , COVID-19/epidemiología , COVID-19/prevención & control , COVID-19/transmisión , Femenino , Personal de Salud , Fuerza Laboral en Salud/estadística & datos numéricos , Humanos , Control de Infecciones/métodos , Control de Infecciones/organización & administración , Masculino , Massachusetts/epidemiología , Salud Laboral , Administración de la Seguridad/organización & administración , Lugar de Trabajo/organización & administración , Lugar de Trabajo/normasAsunto(s)
Prueba de COVID-19 , COVID-19 , Personal de Salud , Hospitales Pediátricos/estadística & datos numéricos , Exposición Profesional , SARS-CoV-2/aislamiento & purificación , Adulto , COVID-19/diagnóstico , COVID-19/epidemiología , COVID-19/prevención & control , Prueba de COVID-19/métodos , Prueba de COVID-19/estadística & datos numéricos , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Femenino , Personal de Salud/clasificación , Personal de Salud/estadística & datos numéricos , Humanos , Control de Infecciones/métodos , Italia/epidemiología , Masculino , Exposición Profesional/análisis , Exposición Profesional/prevención & control , Prevalencia , Estudios SeroepidemiológicosAsunto(s)
COVID-19 , Control de Enfermedades Transmisibles , COVID-19/epidemiología , COVID-19/prevención & control , Control de Enfermedades Transmisibles/métodos , Control de Enfermedades Transmisibles/organización & administración , Trazado de Contacto/métodos , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/estadística & datos numéricos , Humanos , Irán/epidemiología , Evaluación de Necesidades , Distanciamiento Físico , Prevalencia , SARS-CoV-2/aislamiento & purificaciónAsunto(s)
Abdomen Agudo , COVID-19 , Meningitis , Miocarditis , Pediatría , Sepsis , Síndrome de Respuesta Inflamatoria Sistémica , Abdomen Agudo/diagnóstico , Abdomen Agudo/etiología , COVID-19/diagnóstico , COVID-19/epidemiología , COVID-19/fisiopatología , COVID-19/prevención & control , COVID-19/terapia , Niño , Control de Enfermedades Transmisibles/métodos , Diagnóstico Diferencial , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Servicios Médicos de Urgencia/métodos , Servicios Médicos de Urgencia/organización & administración , Humanos , Meningitis/diagnóstico , Meningitis/etiología , Miocarditis/diagnóstico , Miocarditis/etiología , Pediatría/métodos , Pediatría/organización & administración , Pediatría/normas , Infecciones del Sistema Respiratorio/diagnóstico , Infecciones del Sistema Respiratorio/virología , SARS-CoV-2 , Sepsis/diagnóstico , Sepsis/etiología , Evaluación de Síntomas/métodos , Síndrome de Respuesta Inflamatoria Sistémica/diagnóstico , Síndrome de Respuesta Inflamatoria Sistémica/fisiopatología , Síndrome de Respuesta Inflamatoria Sistémica/terapia , Estados Unidos/epidemiologíaAsunto(s)
Betacoronavirus , Infecciones por Coronavirus/epidemiología , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Guías como Asunto , Pandemias/prevención & control , Equipo de Protección Personal/provisión & distribución , Neumonía Viral/epidemiología , COVID-19 , Infecciones por Coronavirus/transmisión , Humanos , Neumonía Viral/transmisión , SARS-CoV-2RESUMEN
In response to the COVID19 pandemic, many countries have implemented lockdowns in multiple phases to ensure social distancing and quarantining of the infected subjects. Subsequent unlocks to reopen the economies started next waves of infection and imposed an extra burden on quarantine to keep the reproduction number ([Formula: see text]) < 1. However, most countries could not effectively contain the infection spread, suggesting identification of the potential sources weakening the effect of lockdowns could help design better informed lockdown-unlock cycles in the future. Here, through building quantitative epidemic models and analyzing the metadata of 50 countries from across the continents we first found that the estimated value of [Formula: see text], adjusted w.r.t the distribution of medical facilities and virus clades correlates strongly with the testing rates in a country. Since the testing capacity of a country is limited by its medical resources, we investigated if a cost-benefit trade-off can be designed connecting testing rate and extent of unlocking. We present a strategy to optimize this trade-off in a country specific manner by providing a quantitative estimate of testing and quarantine rates required to allow different extents of unlocks while aiming to maintain [Formula: see text]. We further show that a small fraction of superspreaders can dramatically increase the number of infected individuals even during strict lockdowns by strengthening the positive feedback loop driving infection spread. Harnessing the benefit of optimized country-specific testing rates would critically require minimizing the movement of these superspreaders via strict social distancing norms, such that the positive feedback driven switch-like exponential spread phase of infection can be avoided/delayed.
Asunto(s)
COVID-19/prevención & control , Trazado de Contacto , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Modelos Epidemiológicos , Distanciamiento Físico , Cuarentena , SARS-CoV-2/crecimiento & desarrollo , Replicación Viral , COVID-19/epidemiología , COVID-19/transmisión , COVID-19/virología , Prueba de COVID-19 , Portador Sano , Humanos , Metadatos , SARS-CoV-2/patogenicidad , Factores de TiempoAsunto(s)
COVID-19 , Control de Enfermedades Transmisibles , Transmisión de Enfermedad Infecciosa , Composición Familiar , SARS-CoV-2/aislamiento & purificación , Adulto , COVID-19/epidemiología , COVID-19/prevención & control , COVID-19/transmisión , Prueba de Ácido Nucleico para COVID-19/estadística & datos numéricos , Control de Enfermedades Transmisibles/métodos , Control de Enfermedades Transmisibles/organización & administración , Punto Alto de Contagio de Enfermedades , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/prevención & control , Transmisión de Enfermedad Infecciosa/estadística & datos numéricos , Registros Electrónicos de Salud/estadística & datos numéricos , Femenino , Humanos , Masculino , Massachusetts/epidemiología , Persona de Mediana Edad , Medición de Riesgo/métodos , Factores de RiesgoRESUMEN
Health care-associated infections (HAIs) account for many morbidity and mortality worldwide, with disproportionate adverse effects in low- and middle-income countries (LMIC). Many factors contribute to the impact in LMIC, including lack of infrastructure, inconsistent surveillance, deficiency in trained personnel and infection control programs, and poverty-related factors. Therefore, optimal approaches must be tailored for LMIC and balance effectiveness and cost in the control of HAIs.